Pięć wariantów genetycznych związanych z rakiem prostaty

Zgadzamy się z Zheng et al. (Wydanie 28 lutego) 1, że potrzebne są dodatkowe badania, aby ocenić wartość ich odkrycia wariantów genetycznych związanych z ryzykiem raka prostaty. Niestety planowana sprzedaż testu na podstawie tego badania2 jest przedwczesna i może przynieść więcej szkody niż pożytku. Znalezienie powiązania genetycznego jest tylko pierwszym krokiem w kontynuacji przekładania badań na praktykę.3 Wyniki nie zostały niezależnie potwierdzone, a dodanie wyników badań genetycznych do wieku, regionu i historii rodziny jedynie nieznacznie poprawiło przewidywanie ryzyka (obszar pod krzywa [AUC] wzrosła z 0,61 do 0,63). Kliniczna użyteczność testu jest wątpliwa, ponieważ nie można go wykorzystać do zmniejszenia ryzyka, ponieważ nie istnieją żadne znane modyfikowalne czynniki ryzyka4; zachęcać do badań przesiewowych, ponieważ bilans korzyści i szkód jest nieznany5; lub przewidzieć kliniczny przebieg choroby, ponieważ warianty były związane w równym stopniu z agresywnymi i nieagresywnymi rakami.1 W przypadku braku dowodów na poprawę wyników, test ten może prowadzić do niepotrzebnych lub potencjalnie szkodliwych procedur.
Ralph J. Coates, Ph.D.
Muin J. Khoury, MD
Marta Gwinn, MD
Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA 30341
Gov
5 Referencje1. Zheng SL, Sun J, Wiklund F, i in. Kumulacyjne połączenie pięciu wariantów genetycznych z rakiem prostaty. N Engl J Med 2008; 358: 910-919
Bezpłatny, pełny tekst Web of Science Medline
2. Kolata G. 300 dolarów na naukę ryzyka raka prostaty. New York Times. 17 stycznia 2008 r.

3. Khoury MJ, Gwinn M, Yoon PW, Dowling N, Moore CA, Bradley L. Kontinuum badań translacyjnych w medycynie genomicznej: w jaki sposób możemy przyspieszyć odpowiednią integrację odkryć ludzkich genomu w opiekę zdrowotną i zapobieganie chorobom. Genet Med 2007; 9: 665-674
Crossref Web of Science Medline
4. Nelen S. Epidemiologia raka prostaty. Ostatnie wyniki Cancer Res 2007; 175: 1-8
Crossref Medline
5. US. Siła robocza Preventive Services. Badania przesiewowe w kierunku raka prostaty: zalecenia i uzasadnienie. Ann Intern Med 2002; 137: 915-916
Web of Science Medline
Tabela 1. Tabela 1. Wykonanie testu przesiewowego w kierunku raka prostaty na podstawie sześciu czynników ryzyka (pięć polimorfizmów genetycznych plus historia rodziny). W swoim towarzyszącym artykule redakcyjnym Gelmann stwierdza, że pięć polimorfizmów zgłoszonych przez Zheng et al. nie stanowią jeszcze realnego testu przesiewowego.1 Myślimy, że nigdy tego nie zrobią. Zastosowanie genetycznych polimorfizmów o skromnych ilorazach szans (1,22 do 1,53 w badaniu przeprowadzonym przez Zhenga i wsp.) W celu zbadania poligenowej choroby, takiej jak rak gruczołu krokowego, jest mało prawdopodobne, ponieważ większość mężczyzn, bez względu na to, czy chorują na raka prostaty, czy nie. być średnio zagrożone genetycznie.2 W badaniu przeprowadzonym przez Zhenga i wsp. większość pacjentów z przypadkami i osobami kontrolnymi miało jeden do trzech czynników ryzyka (85,5% przypadków pacjentów i 86,2% osób kontrolnych) i mniej niż 10% przypadków poddani byli na wysokie ryzyko. Test oparty na tych polimorfizmach nie jest w stanie prawidłowo rozróżnić między pacjentami z przypadkami a osobnikami z grupy kontrolnej i nie będzie większości przypadków lub będzie miał wyniki fałszywie dodatnie w przypadku większości kontroli (Tabela 1) Znajduje to odzwierciedlenie w bardzo słabym AUC charakterystyki operacyjnej odbiornika, nawet gdy geny te są połączone z innymi czynnikami ryzyka (AUC, 0,63), co nie jest dużo lepsze niż oczekiwane przez przypadek (AUC, 0,50).
Coral E. Gartner, Ph.D.
Jan J. Barendregt, Ph.D.
Wayne D. Hall, Ph.D.
University of Queensland, Brisbane, QLD 4006, Australia
do. uq.edu.au
2 Referencje1. Gelmann EP. Złożoność ryzyka raka prostaty. N Engl J Med 2008; 358: 961-963
Full Text Web of Science Medline
2. Wald NJ, Hackshaw AK, Frost CD. Kiedy można wykorzystać czynnik ryzyka jako wartościowy test przesiewowy. BMJ 1999; 319: 1562-1565
Crossref Web of Science Medline
Zheng i in. donoszą, że łączny efekt historii rodzinnej i pięciu polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP) na ryzyko raka prostaty został zwiększony o czynnik 9,46 dla mężczyzn, którzy mieli co najmniej pięć czynników w porównaniu z tymi, którzy ich nie mieli. Jest to sprzeczne z niską dokładnością rozróżniania, którą zaobserwowali (AUC, 0,63). Do obliczenia tego ilorazu szans porównali stosunkowo niewielką kategorię najwyższego ryzyka z kategorią najniższego ryzyka. Wybór kategorii niskiego ryzyka jako odniesienia jest często stosowanym i silnym podejściem do wykazania związku 1,2, ale nie daje realistycznego wrażenia klinicznej użyteczności wyników. Aby ocenić wzrost lub zmniejszenie ryzyka choroby w porównaniu z ryzykiem wstępnym lub ogólnym, ponownie obliczyliśmy iloraz szans, pokazany w Tabeli 4 artykułu, na podstawie liczby powiązanych czynników w następujący sposób: brak powiązanych czynników, 0,49 (obserwowane w 10% kontroli); jeden czynnik, 0,80 (34%); dwa czynniki, 1,01 (36%); trzy czynniki, 1,34 (17%); cztery czynniki, 2,35 (3%); i pięć lub więcej czynników, 4,78 (<1%). Chociaż ustalenia Zheng et al. są bardzo interesujące, ich analiza AUC i proste ponowne obliczenie ich danych pokazują, że implikacje kliniczne są ograniczone.
A. Cecile JW Janssens, Ph.D.
Cornelia M. van Duijn, Ph.D.
Centrum Medyczne Uniwersytetu Erasmus, 3000 DR Rotterdam, Holandia
za. nl
2 Referencje1. Lyssenko V, Almgren P, Anevski D, i in. Prognozy genetyczne przyszłej cukrzycy typu 2. PLoS Med 2005; 2: e345-e345
Crossref Web of Science Medline
2. Maller J, George S, Purcell S, i in. Powszechna zmienność trzech genów, w tym wariant niekodujący w CFH, silnie wpływa na ryzyko związane z wiekiem zwyrodnienia plamki żółtej. Nat Genet 2006; 38: 1055-1059
Crossref Web of Science Medline
Oświadczenie Zheng et al. że pięć SNP i historia rodzinna stanowią 46% przypadków raka prostaty jest myląca. Przywołali pojęcie frakcji zależnej od populacji (PAF), a nie ryzyka związanego z populacją, ponieważ błędnie ją nazwali. PAF w przybliżeniu proporcjonalnie zapobiega chorobie poprzez eliminację czynnika ryzyka.1 Jego zastosowanie do genetyki jest wątpliwe.
Żaden z wariantów nie jest znany jako przyczynowy; eliminacja wariantów, nawet jeśli to możliwe, niekoniecznie zapobiegnie rakowi prostaty. W każdym razie PAF jest wysoce zależny od grupy odniesienia.1 Szersza definicja, niż wybór autorów przez mężczyzn bez alleli ryzyka (10% kontroli) prowadziłaby do niższego PAF.
Lepszą miarą wpływu mierzonych genów na chorobę jest zakres, w jakim wyjaśniają one zwiększone ryzyko związane z występowaniem względnego pierwszego stopnia stopnia 2. Po dostosowaniu do SNP efekt historii rodziny zos
[patrz też: oczyszczanie jelita grubego domowymi sposobami, rękawice bramkarskie allegro, dieta owocowo warzywna opinie ]

Powiązane tematy z artykułem: dieta owocowo warzywna opinie oczyszczanie jelita grubego domowymi sposobami rękawice bramkarskie allegro